生化妊娠发生的原因即可能胚胎本身质量异常，也可能是孕妇自身疾病，生殖器官发育异场或者内分泌紊乱，另外胎儿父亲精子异场及外环境不良刺激等均可导致生化妊娠 。生化妊娠是精子和卵子结合后没有成功着床，随后排出体外 。可以说是一种优胜劣汰的现象 。
第一次出现大多是因为受精卵本身的原因，可再次怀孕的 。
关于流产，很多妈妈自然而然就想到了对身体的伤害，但其实生化妊娠发生的时间都比较早，而且也并不能够算是临床意义上的怀孕，因此对于女性的身体伤害是比较小的 。偶尔一次的生化妊娠一般对于下次的怀孕不会造成影响，因为本身就如同来一次月经而已；但是如果两次及两次以上的生化，则需要按照复发性流产系统的进行检查 。
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